Q-Scoreとは？
Qスコアとは、遺伝子シーケンシング（配列解析）における「精度の指標」を示す数値です。具体的には、シーケンスデータ中の各塩基（DNAの構成単位）の判定がどれほど正確かを示すものです。このQスコアが高いほど、シーケンスの正確さも高いとみなされます。
Qスコアは10、20、30といった数字で表され、たとえば「Q30」は「1000個の塩基に1つだけエラーがある可能性」を示します。臨床で一般的に使用される基準はQ30以上で、これは1000個の塩基中にわずか1つのエラーがある程度の精度を指します。Qスコアが上がるほどエラーの頻度は下がり、例えばQ40であれば「10,000個の塩基に1つのエラー」という非常に高い精度となります。AVITIはQ40以上の精度を保っており、最新のAVITI24ではQ50の結果が出ています。
こうしたQスコアの導入により、シーケンスの正確性が数値で評価できるようになり、検査の信頼性向上や、診断や治療方針決定における情報の質の確保が実現されています。
| 品質スコア | 解釈 |
|---|---|
| Q10 | 10塩基ごとに1つのエラー |
| Q20 | 100塩基ごとに1つのエラー |
| Q30 | 1000塩基ごとに1つのエラー |
| Q40 | 10,000塩基ごとに1つのエラー |
| Q50 | 100,000塩基ごとに1つのエラー |
私たちが実際に再現したデータ
これはPhiX(標準となるコントロールの様なもの)を使って、実際に私たちがAVITIを使って解読した時の結果です。キットは2×150 Cloudbreak Highを使用しました。40を超える非常に高いQ scoreが保たれており、AVITIの精度の高さを確認することができました。
また、私たちが研究で使用したサンプルを解読した際の結果ですが、実際に使用した際も高いQ scoreを維持しており、AVITIの精度の高さを確認することができます。
まとめ
このように、Element BiosciencesのABC技術は、シーケンシングの精度を保ちながらもコストを下げ、効率的にDNAの構造を解析することを可能にしています。
高い精度が出る理由は、ぜひ下記のブログをご参照ください。
AVITIの解析を試してみよう！
MEDBANKでは、次世代シーケンサーAVITIでの解析を受託しております。上記で精度が高いことを占めましたが、従来のイルミナ社のシーケンスと比較して、非常に短い納期かつ低コストでも解析が可能です。初めての方や、遺伝子解析を行ったことがない臨床医の先生でもサポートいたしますので、まずはお気軽にお問い合わせください。
※図や文献は、Element Biosciencesのアメリカ本社の許可を得て、Element Biosciencesが提供する資料等をもとに掲載しております。
